Cell | 免疫疾病中免疫细胞特异性状调控动态全景图

东京帝国大学的科学研究其他部门和RIKEN Research科学研究所的老友们已经构建了首个针对自身免疫反应性传染病和自身炎症性传染病的蛋白质资料库。希望这一能源能为免疫反应传染病的转变提供新的观点，并似乎有助于药物的发掘显露。研究团队们还希望，与免疫反应就其的蛋白质组资料图说再次似乎应用于诸如COVID-19等传染病的科学研究。

东京帝国大学项目科学研究助理，外科风湿病学家，功能蛋白质组学专家Mineto Ota博士说是：“要知晓传染病，就必须深刻理解蛋白质变异的功能。有了这个资料集，我们就可以将与传染病就其的DNA脱氧核糖核酸变动的资料与对传染病发病选择性相当不可忽视的蛋白质和巨噬细胞一般来说是保持联系痛快。”Ota是该团队发表在《Cell》杂志上的篇文章的主要作者，篇文章标题为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该项目是与Chugai Pharmaceutical的研究团队们协作透过的。

作者写道，免疫反应内皮细胞的传染病（IMD）除此以外从自身免疫反应性到自身炎症的多种病理。他们指显露，尽管IMD之中炎性巨噬细胞因子的异常活动指出免疫反应巨噬细胞功能发生了变动，但是，“对于IMD的就其蛋白质甚至就其巨噬细胞一般来说是知之甚少。”

以外蛋白质组保持联系科学研究（GWAS）发掘显露了许多与IMD就其的蛋白质组位点。但是，在此类保持联系科学研究之中深入研究显露的许多蛋白质变异都座落在恒定蛋白质“on”或“off”理解的DNA非脱氧核糖核酸范围内，而不是座落在蛋白质脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸之中。科学研究人小组指显露：“GWAS已经阐明了许多与复杂遗传和传染病就其的蛋白质组位点，除此以外IMD。这些变异之中的大多数都座落在非脱氧核糖核酸蛋白质组范围内，尤其是依赖性元件，如增强子和启动子。”

为了阐明依赖性DNA的功能，一种不尽相异一般来说是的蛋白质组持续性，称为理解表征遗传蛋白质位点（eQTL），旨在将DNA脱氧核糖核酸的差别与蛋白质理解的差别保持联系痛快。为了让eQTL资料，科学研究其他部门可以对依赖性DNA脱氧核糖核酸的目的、依赖性脱氧核糖核酸之中的变异如何不良影响其依赖性蛋白质的理解以及这些蛋白质理解差别如何造成传染病做显露更明智的暗示。

其它针对免疫反应的eQTL科学研究已经在透过之中，但更进一步的科学深入研究只除此以外有益红十字会，并检查了有限数量的巨噬细胞一般来说是。科学研究其他部门写道：“对有益小分子免疫反应巨噬细胞的科学研究似乎只能猎取传染病长时间下发掘显露的一系列eQTL效应。此外，虽然对免疫反应巨噬细胞的实验性激发可以在并不一定一定上模拟传染病长时间，但并不一定总是反映显露体内的生理生态。”

Ota补充道：“炎症长时间下，免疫反应巨噬细胞的物理特性与有益长时间下的相异巨噬细胞异于。与免疫反应状况就其的蛋白质变异似乎只在患病长时间下起发挥作用，因此对于这种一般来说是的蛋白质科学研究，从真实病患者身上获取采样相当不可忽视。”

在他们最新报导的科学研究之中，科学研究人小组对79名有益红十字会和337名被病患脑癌10种不尽相异一般来说是免疫反应内皮细胞传染病（除此以外类风湿性关节炎、持续性红斑狼疮和持续性硬化症）的病患者透过了以外蛋白质组人类基因组计划。所有红十字会都是日本帝国混血。

知晓免疫反应内皮细胞的传染病带有启发性，因为尽管每种传染病在外科上都是不尽相异的，但仍有许多重叠之处，并且带有相异病患的病患者似乎会表现显露相当不尽相异的症状。科学研究其他部门补充说是：“由于所有这些丰富性，一次学习一种免疫反应内皮细胞传染病的能力是有限的。但是，如果我们两兄弟科学研究10种传染病，就可以更更进一步地知晓这些一般来说是的传染病。”

在顺利完成以外蛋白质组人类基因组计划后，科学研究其他部门从红十字会的尿液采样之中分离显露28种不尽相异一般来说是的免疫反应就其巨噬细胞，并探测了这些巨噬细胞之中的蛋白质理解。“我们在图说之中看到，每种免疫反应巨噬细胞一般来说是都有不尽相异的eQTL结果，这可以告诉我们巨噬细胞一般来说是密切关系蛋白质依赖性的差别，以及哪种巨噬细胞一般来说是对于转变哪种传染病至关不可忽视。”科学研究其他部门说是。

作者报告说是，“在蛋白质理解持续性之中，我们在一个平台上对多个IMD透过比较，使我们能够描述每个传染病（病患者）的特征，并辨别与单个传染病特异性就其的蛋白质，以及在一组IMD之中失调的闭环……我们的资料集使我们能够监测每个特定巨噬细胞一般来说是之中eQTL效应的生理（传染病）取材驱动的干扰。”

科学研究其他部门将得到的能源取名为为东京帝国大学免疫反应巨噬细胞蛋白质理解图说（ImmuNexUT），并说是它代表了使用亚洲地区混血红十字会构建的最大的eQTL资料集。他们回顾道：“我们确认了免疫反应巨噬细胞一般来说是特异性的eQTL效应，除此以外以前未曾报导的罕见巨噬细胞一般来说是，它们在生理炎症条件下的丰富性，以及这些eQTL与IMD表现型密切关系的值得注意保持联系。”

“到目前为止，在这一领域，大规模的蛋白质组和功能蛋白质组科学研究主要是为了让西欧**透过的，尽管个体丰富性对于直观理解蛋白质组功能至关不可忽视。”科学研究其他部门说是，“这个日本帝国病人的eQTL图说对于克服这种以西欧为之中心的成见，结合西欧的资料集进一步科学研究DNA变异的功能，也带有不可忽视意义。”

科学研究其他部门希望ImmuNexUT资料库将独自增长，并再次为病患者带来更高的结果。他们说是：“与以后报导的能源相比，我们的资料集带有独特而险恶的优点，除此以外更进一步的免疫反应巨噬细胞区分、**密切关系免疫反应状况的变动以及理论上的非西欧**。”